A watershed based segmentation method for multispectral chromosome images classification
Φόρτωση...
Ημερομηνία
Συγγραφείς
Karvelis, P. S.
Fotiadis, D. I.
Georgiou, I.
Syrrou, M.
Τίτλος Εφημερίδας
Περιοδικό ISSN
Τίτλος τόμου
Εκδότης
Περίληψη
Τύπος
Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο
Είδος περιοδικού
peer-reviewed
Είδος εκπαιδευτικού υλικού
Όνομα συνεδρίου
Όνομα περιοδικού
Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc
Όνομα βιβλίου
Σειρά βιβλίου
Έκδοση βιβλίου
Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος
Περιγραφή
M-FISH (multicolor fluorescence in situ hybridization) is a recently developed cytogenetic technique for cancer diagnosis and research on genetic disorders which uses 5 fluors to label uniquely each chromosome and a fluorescent DNA stain. In this paper, an automated method for chromosome classification in M-FISH images is presented. The chromosome image is initially decomposed into a set of primitive homogeneous regions through the morphological watershed transform applied to the image intensity gradient magnitude. Each segmented area is then classified using a Bayes classifier. We have evaluated our methodology on a commercial available M-FISH database. The classifier was trained and tested on non-overlapping chromosome images and an overall accuracy of 89% is achieved. By introducing feature averaging on watershed basins, the proposed technique achieves substantially better results than previous methods at a lower computational cost.
Περιγραφή
Λέξεις-κλειδιά
Biomedical Engineering, Chromosomes, Human/*classification/genetics/ultrastructure, Databases, Factual, Female, Fluorescent Dyes, Humans, Image Interpretation, Computer-Assisted, In Situ Hybridization, Fluorescence/*methods/statistics & numerical data, Male
Θεματική κατηγορία
Παραπομπή
Σύνδεσμος
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17946153
http://ieeexplore.ieee.org/ielx5/4028925/4461641/04462430.pdf?tp=&arnumber=4462430&isnumber=4461641
http://ieeexplore.ieee.org/ielx5/4028925/4461641/04462430.pdf?tp=&arnumber=4462430&isnumber=4461641
Γλώσσα
en
Εκδίδον τμήμα/τομέας
Όνομα επιβλέποντος
Εξεταστική επιτροπή
Γενική Περιγραφή / Σχόλια
Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής