Διαμεμβρανική μεταφορά νουκλεοσιδίων και αναλόγων νουκλεοσιδίων από βακτήρια του μικροβιώματος
| dc.contributor.author | Ιωσηφίδου, Νικολέτα | el |
| dc.contributor.author | Iosifidou, Nikoleta | en |
| dc.date.accessioned | 2023-09-22T12:56:19Z | |
| dc.date.available | 2023-09-22T12:56:19Z | |
| dc.identifier.uri | https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/33060 | |
| dc.identifier.uri | http://dx.doi.org/10.26268/heal.uoi.12859 | |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ | * |
| dc.subject | Γεμσιταβίνη (dFdC) | el |
| dc.subject | Μεταφορείς νουκλεοσιδίων | el |
| dc.subject | Ανάπτυξη Χημειοανθεκτικότητας | el |
| dc.subject | Μικροβίωμα Ανθρώπινων Όγκων | el |
| dc.subject | Νέοι Θεραπευτικοί Στόχοι | el |
| dc.title | Διαμεμβρανική μεταφορά νουκλεοσιδίων και αναλόγων νουκλεοσιδίων από βακτήρια του μικροβιώματος | el |
| dc.title | Transmembrane transport of nucleosides and nucleoside analogs by bacteria of the microbiome | en |
| dc.type | masterThesis | en |
| heal.abstract | Ένα από τα ευρύτερα χρησιμοποιούμενα αντικαρκινικά φάρμακα, η γεμσιταβίνη (dFdC), ανάλογο του νουκλεοσιδίου της κυτιδίνης, αποτελεί «χρυσό κανόνα» για την αντιμετώπιση επιθετικών καρκίνων του παγκρέατος. Πρόσφατα (Geller et al., 2017) δείχθηκε ότι τα βακτήρια που εποικίζουν καρκινικούς όγκους συμβάλλουν στην ανάπτυξη ανθεκτικότητας έναντι του φαρμάκου μεταβολίζοντάς το στην ανενεργή του μορφή (dFdU). Το φαινόμενο συσχετίσθηκε με συγκεκριμένα είδη γ-Πρωτεοβακτηρίων (κυρίως Pseudomonas putida, Klebsiella pneumoniae και Citrobacter freundii), τα οποία περιέχουν πολλαπλούς δυνητικούς μεταφορείς που θα μπορούσαν να είναι υπεύθυνοι για την πρόσληψη του ανάλογου dFdC. Η παρούσα μεταπτυχιακή διατριβή ασχολείται με την ταυτοποίηση πιθανών μεταφορέων γεμσιταβίνης των βακτηριακών ειδών Klebsiella pneumoniae και Citrobacter freundii. Έχοντας ως βάση τους κύριους μεταφορείς γεμσιταβίνης της Escherichia coli K-12, NupC και NupG (Anagnostopoulou, Botou, and Frilingos, αδημοσίευτα αποτελέσματα), πραγματοποιήθηκε φυλογενετική ανάλυση των πιθανών μεταφορέων νουκλεοσιδίων των αντίστοιχων οικογενειών, CNT (NupC-like) και NHS (NupG-like), σε όλα τα Πρωτεοβακτήρια. Από τους ομόλογους μεταφορείς που εντοπίστηκαν στα δύο βακτήρια, οι συγγενικά κοντινότεροι των δύο μεταφορέων της Ε. coli υποβλήθηκαν σε λειτουργικό χαρακτηρισμό, μέσω ετερόλογης έκφρασης σε κύτταρα Ε. coli JW2389 (ΔnupC). Συνολικά ταυτοποιήθηκαν πέντε, υψηλής συγγένειας, μεταφορείς για τη γεμσιταβίνη (KΜ < 12.5 μΜ και > 2.5 μΜ). Αυτοί είναι οι KpNupC, KpvcCNT και KpNupG από το στέλεχος K. pneumoniae ATCC 25955 και οι CfNupC και CfNupG από το C. freundii ATCC 8090. Επίσης βρέθηκε ότι οι μεταφορείς αυτοί μπορούν να αναγνωρίσουν τα φυσικά πυριδιμινικά νουκλεοσίδια ουριδίνη και κυτιδίνη. Από τα αποτελέσματα αυτά αποδεικνύεται για πρώτη φορά ότι τα παραπάνω βακτηριακά στελέχη που συναντώνται συχνά στο αδενοκαρκίνωμα του παγκρεατικού πόρου (Geller et al., 2017, Nejman et al., 2020) μπορούν να προσλάβουν με υψηλή συγγένεια το ανάλογο dFdC (γεμσιταβίνη). Ταυτόχρονα αναδεικνύεται η σημασία μιας νέας οικογένειας μεταφορέων νουκλεοσιδίων που σχετίζεται με τη διαμεμβρανική μεταφορά γεμσιταβίνης, της οικογένειας NHS, η οποία βρίσκεται μόνο στα βακτήρια, σε αντίθεση με την οικογένεια CNT η οποία είναι ευρέως διαδεδομένη και περιλαμβάνει μεταφορείς γεμσιταβίνης τόσο σε βακτήρια όσο και στον άνθρωπο. Συνολικά, η εργασία αυτή αποτελεί μια αρχική πειραματική βάση, προκειμένου να αναλυθεί περαιτέρω η εμπλοκή συγκεκριμένων βακτηρίων στη διαθεσιμότητα του φαρμάκου εντός των όγκων και κατ’ επέκταση στην ανάπτυξη ανθεκτικότητας των παγκρεατικών καρκινικών κυττάρων έναντι της γεμσιταβίνης. | el |
| heal.abstract | Gemcitabine (dFdC ), a widely used anticancer drug, is considered as a «gold standard» therapy in treating aggressive pancreatic cancers. Recent research (Geller et al., 2017) has revealed that bacteria colonizing cancer tumors play a role in the development of drug resistance. These bacteria metabolize gemcitabine into its inactive form (dFdU), leading to reduced efficacy. This phenomenon has been associated with specific species of γ Proteobacteria, particularly Pseudomonas putida , Klebsiella pneumoniae and Citrobacter freundii , which possess multiple candidate transporters for the uptake of dFdC. In this thesis, we focus on elucidating the potential gemcitabine transporters of two bacterial species, Klebsiella pneumoniae and Citrobacter freundii . Based on NupC and NupG of Escherichia coli K 12, which we identified as the main gemcitabine transporters in E. coli (Anagnostopoulou, Botou, and Frillingos, unpublished data), we conducted a phylogenetic analysis of the putative nucleoside transporters belonging to the CNT (NupC like) and NHS (NupG like) families, across all Proteobacteria. Among the homologous transporters identified in K pneumoniae and C freundii , we focused on the transporters that exhibited close similarity to the E. coli homologs. These transporters were further characterized through functional analysis via heterologous expression in Ε coli JW2389 ( ΔnupC ). A total of five high affinity gemcitabine transporters were identified ( KKΜ < 12.5 µM and > 2.5 µ μM), namely KpNupC, KpvcCNT and KpNupG from K. pneumoniae strain ATCC 25955 and CfNupC and CfNupG from C. freundi strain ATCC 8090. These results reveal that bacterial strains frequently found in pancreatic ductal adenocarcinoma (Geller et al., 2017, Nejman et al., 2020) can effectively transport gemcitabine with high affinity . Additionally, this study highlights the significance of a novel family of nucleoside transporters, the NHS family, which is exclusively found in bacteria in contrast to the CNT family which is widely distributed and includes gemcitabine transporters in both bacteria and humans. Overall, this work provides an initial experimental basis in order to further analyze the involvement of specific bacteria in drug availability within tumors and in the development of gemcitabine resistance in pancreatic cancer cells. | en |
| heal.academicPublisher | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής | el |
| heal.academicPublisherID | uoi | el |
| heal.access | free | el |
| heal.advisorName | Φριλίγγος, Ευστάθιος | el |
| heal.classification | Βακτηριακοί μεταφορείς νουκλεοσιδίων/ανάλογων νουκλεοσιδίων του ανθρώπινου μικροβιώματος | el |
| heal.committeeMemberName | Μπέης, Δημήτριος | el |
| heal.committeeMemberName | Πολίτου, Αναστασία | el |
| heal.committeeMemberName | Χριστοφορίδης, Σάββας | el |
| heal.committeeMemberName | Παπαμαρκάκη, Θωμαΐς | el |
| heal.dateAvailable | 2023-09-22T12:57:19Z | |
| heal.fullTextAvailability | true | |
| heal.language | el | el |
| heal.numberOfPages | 133 σ. | el |
| heal.publicationDate | 2023 | |
| heal.recordProvider | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας | el |
| heal.secondaryTitle | φυλογενετική και λειτουργική χαρτογράφηση των βακτηριακών μεταφορέων της γεμσιταβίνης (dFdC) | el |
| heal.secondaryTitle | phylogenetic and functional mapping of bacterial transporters for gemcitabine (dFdC) | en |
| heal.type | masterThesis | el |
| heal.type.el | Μεταπτυχιακή εργασία | el |
| heal.type.en | Master thesis | en |
Αρχεία
Πρωτότυπος φάκελος/πακέτο
1 - 1 of 1
Φόρτωση...
- Ονομα:
- Μ.Ε. ΙΩΣΗΦΙΔΟΥ ΝΙΚΟΛΕΤΑ (2023).pdf
- Μέγεθος:
- 5.04 MB
- Μορφότυπο:
- Adobe Portable Document Format
- Περιγραφή:
Φάκελος/Πακέτο αδειών
1 - 1 of 1
Φόρτωση...
- Ονομα:
- license.txt
- Μέγεθος:
- 3.22 KB
- Μορφότυπο:
- Item-specific license agreed upon to submission
- Περιγραφή: