Ανάλυση του εκπνεόμενου αέρα ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα για τον προσδιορισμό βιοδεικτών με αέρια χρωματογραφία – φασματομετρία μάζας
Φόρτωση...
Ημερομηνία
Συγγραφείς
Βερτζάγια, Αντωνία
Vertzagia, Antonia
Τίτλος Εφημερίδας
Περιοδικό ISSN
Τίτλος τόμου
Εκδότης
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Περίληψη
Τύπος
Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο
Είδος περιοδικού
Είδος εκπαιδευτικού υλικού
Όνομα συνεδρίου
Όνομα περιοδικού
Όνομα βιβλίου
Σειρά βιβλίου
Έκδοση βιβλίου
Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος
Περιγραφή
Κάθε χρόνο ο αριθμός των ασθενών που προσβάλλονται από διάφορους τύπους καρκίνου
αυξάνεται δραματικά, γι’ αυτό το λόγο οι έρευνες έχουν στραφεί στην ανακάλυψη και
εφαρμογή μεθόδων οι οποίες θα μπορούν να ανιχνεύσουν τέτοιες ασθένειες σε πολύ
πρώιμο στάδιο και ίσως και στην πρόγνωσή τους πριν ακόμα αυτές εκδηλωθούν. Στην
παρούσα διατριβή το είδος του καρκίνου που μελετάται είναι ο καρκίνος του πνεύμονα που
αποτελεί τη συχνότερη μορφή καρκίνου παγκοσμίως και σημειώνει τα μεγαλύτερα ποσοστά
θνησιμότητας. Η έρευνα για την επίτευξη του σκοπού αυτού εστιάστηκε στους μεταβολίτες,
οι οποίοι αποτελούν τα τελικά προϊόντα των βιολογικών διεργασιών που πραγματοποιούνται
εντός του οργανισμού και εφόσον περιέχονται σχεδόν σε όλα τα βιολογικά υγρά και στην
ανθρώπινη αναπνοή, μπορούν να είναι ενδεικτικοί για την ύπαρξη κάποιας δυσλειτουργίας
του. Ο τομέας που μελετά τους μεταβολίτες ονομάζεται μεταβολομική και αποτελεί μία
«υψηλής απόδοσης» ανάλυση. Σε αυτή την έρευνα γίνεται ανάλυση του εκπνεόμενου αέρα
και των πτητικών οργανικών ενώσεων που περιέχονται σε αυτόν, τόσο σε ασθενείς που
πάσχουν από τον καρκίνο του πνεύμονα, όσο και σε υγιείς. Για την πραγματοποίηση της
ανάλυσης είναι απαραίτητη η συλλογή των VOCs η οποία γίνεται με τη βοήθεια των σωλήνων
RTubeVOC. Η ανάλυση απαιτεί προσρόφηση των πτητικών οργανικών ενώσεων σε ένα
στερεό φορέα διαφορετικά δεν είναι δυνατή η ανάλυση του αέριου υποστρώματος. Η
προσρόφηση γίνεται με τη διαδικασία της τεχνικής μικροεκχύλισης στερεάς φάσης (SPME).
Στη συνέχεια γίνεται εκρόφηση των προσροφημένων ουσιών σε αέριο χρωματογράφο ο
οποίος είναι συζευγμένος με φασματόμετρο μάζας. Τα φάσματα μάζας και τα αέρια
χρωματογραφήματα που προκύπτουν είναι αρκετά πολύπλοκα, για αυτό το λόγο
χρησιμοποιούνται προγράμματα που συμβάλλουν στην επεξεργασία των πρωτογενών
δεδομένων (raw data) όπως το XCMSOnilne, MetaboAnalyst 5.0 και το SIMCA. Τέλος γίνεται
στατιστική επεξεργασία προκειμένου να γίνει διαχωρισμός των ομάδων με εφαρμογή των
μοντέλων PCA, PLS-DA και OPLS-DA, αλλά και προσδιορισμός των χαρακτηριστικών στα
οποία οφείλεται ο διαχωρισμός. Η ταυτοποίηση αυτών των χαρακτηριστικών γίνεται με τη
βοήθεια της βιβλιοθήκης NIST.
Every year the number of patients that have been affected by various types of cancer increases dramatically, for this reason research has turned into the discovery and application of methods that will be able to detect these kinds of diseases at a very early stage and perhaps the prognosis of the disease before its onset. The subject of the research in the present thesis is the lung cancer, which is the most common form of cancer worldwide with the highest mortality rates. The field used to achieve this goal is the field of metabolomics which is a “high performance” analysis and directly related to the human body as it studies the products of human metabolism, the metabolites. Metabolites are organic compounds that can often be indicative of any dysfunction of the human body and are present in almost all biological fluids. In this research, an analysis of the exhaled air and the volatile organic compounds contained in it is performed in patients with lung cancer but also in healthy people. To carry out the analysis, it is necessary to collect the VOCs and for that the RTubeVOC tubes are used. The analysis requires adsorption of the volatile organic compounds in a solid carrier otherwise the analysis of the gaseous substrate is not possible. The adsorption is carried out by the procedure of solid phase micro-extraction (SPME). Subsequently, the adsorbed substances are desorbed on a gas chromatograph coupled to a mass spectrometer. After the analysis, the chromatograms and mass spectra are obtained, which are complex data and difficult to analyze. For this reason, programs that contribute to the processing of raw data such as XCMSOnilne, MetaboAnalyst 5.0 and the SIMCA program are used. Finally, statistical processing is carried out to separate the groups by applying the PCA, PLS-DA and OPLS-DA models, as well as to determine the characteristics underlying the separation. These features are identified with the help of the NIST library.
Every year the number of patients that have been affected by various types of cancer increases dramatically, for this reason research has turned into the discovery and application of methods that will be able to detect these kinds of diseases at a very early stage and perhaps the prognosis of the disease before its onset. The subject of the research in the present thesis is the lung cancer, which is the most common form of cancer worldwide with the highest mortality rates. The field used to achieve this goal is the field of metabolomics which is a “high performance” analysis and directly related to the human body as it studies the products of human metabolism, the metabolites. Metabolites are organic compounds that can often be indicative of any dysfunction of the human body and are present in almost all biological fluids. In this research, an analysis of the exhaled air and the volatile organic compounds contained in it is performed in patients with lung cancer but also in healthy people. To carry out the analysis, it is necessary to collect the VOCs and for that the RTubeVOC tubes are used. The analysis requires adsorption of the volatile organic compounds in a solid carrier otherwise the analysis of the gaseous substrate is not possible. The adsorption is carried out by the procedure of solid phase micro-extraction (SPME). Subsequently, the adsorbed substances are desorbed on a gas chromatograph coupled to a mass spectrometer. After the analysis, the chromatograms and mass spectra are obtained, which are complex data and difficult to analyze. For this reason, programs that contribute to the processing of raw data such as XCMSOnilne, MetaboAnalyst 5.0 and the SIMCA program are used. Finally, statistical processing is carried out to separate the groups by applying the PCA, PLS-DA and OPLS-DA models, as well as to determine the characteristics underlying the separation. These features are identified with the help of the NIST library.
Περιγραφή
Λέξεις-κλειδιά
Αέρια χρωματογραφία, Καρκίνος του πνεύμονα, Βιοδείκτες, Μικροεκχύλιση στερεής φάσης, Μεταβολομική, Gas chromatography, Lung cancer, Biomarkers, Solid phase microextraction, Metabolomic
Θεματική κατηγορία
Παραπομπή
Σύνδεσμος
Γλώσσα
el
Εκδίδον τμήμα/τομέας
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Όνομα επιβλέποντος
Σακκάς, Βασίλειος
Εξεταστική επιτροπή
Σακκάς, Βασίλειος
Κωστίκας, Κωνσταντίνος
Σταλίκας, Κωνσταντίνος
Κωστίκας, Κωνσταντίνος
Σταλίκας, Κωνσταντίνος
Γενική Περιγραφή / Σχόλια
Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών
Πίνακας περιεχομένων
Χορηγός
Βιβλιογραφική αναφορά
Ονόματα συντελεστών
Αριθμός σελίδων
97 σ.
Λεπτομέρειες μαθήματος
item.page.endorsement
item.page.review
item.page.supplemented
item.page.referenced
Άδεια Creative Commons
Άδεια χρήσης της εγγραφής: Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States