Συνεισφορά στην βελτιστοποίηση των θερμοδυναμικών παραμέτρων 3Ν συμπλόκων Cu(II) με πεπτίδια που φέρουν το αμινοξύ ιστιδίνη για χρήση σε βιολογικές-ιατρικές εφαρμογές
Loading...
Date
Authors
Παπαδόπουλος, Περικλής
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Abstract
Type
Type of the conference item
Journal type
Educational material type
Conference Name
Journal name
Book name
Book series
Book edition
Alternative title / Subtitle
Description
Στην παρούσα εργασία μελετήσαμε την αλληλεπίδραση του ιόντος Cu(II) με τα πεπτίδια H2N-Lys-His-Asp-Ser-Gly-amide και H2N-Asn-His-Asp-Ser-Gly-amide σε μια προσπάθεια διερεύνησης των παραγόντων που μπορεί να οδηγήσουν στην βελτιστοποίηση της δεσμευτικής τους ικανότητας έναντι του μετάλλου. Ως πεπτίδιο αναφοράς χρησιμοποιήθηκε το Αβ5-9 (H2N-Arg-His-Asp-Ser-Gly-amide). Το συγκεκριμένο αποτελεί μοντέλο του θραύσματος Αβ5-42 του αμυλοειδούς πεπτιδίου (Αβ), το οποίο ως γνωστόν είναι το κύριο συστατικό των αμυλοειδών πλακών που σχηματίζονται στον εγκέφαλο ασθενών που πάσχουν απ’ την νόσο Alzheimer. Η επιλογή της παραπάνω αλληλουχίας βασίστηκε στο γεγονός της ισχυρής αλληλεπίδρασής του με τα ιόντα χαλκού. Αλλάζοντας το Ν-τελικό αμινοξύ του Aβ5-9 (στη θέση της Arg Lys, Asn αντίστοιχα) και μελετώντας θερμοδυναμικά (ποτενσιομετρία) και φασματοσκοπικά (UV-Vis) τα συστήματα Cu(II)-πεπτιδίων, μας επέτρεψε να ελέγξουμε την επίδραση της παραπάνω αλλαγής στην δεσμευτική τους ικανότητα.
Τα δύο πεπτίδια αλληλεπιδρούν αποτελεσματικά με τα ιόντα Cu(II) οδηγώντας στον σχηματισμό συμπλόκων στοιχειομετρίας Cu(II):πεπτίδιο 1:1, στην περιοχή pH 3-12. Όσον αφορά τον τρόπο ένταξής τους, συμπεριφέρονται όπως αναμένεται για πεπτίδια με ελεύθερη αμινομάδα και ιστιδίνη στη θέση 2 (σχηματισμός 3Ν συμπλόκων με σφαίρα ένταξης τύπου (ΝΗ2, Ν-, Νim, Χ) όπου Χ=Η2Ο ή ΟΗ-). Αποδείχθηκε επίσης ότι και τα δυο είναι πιο αποτελεσματικά όσον αφορά την δέσμευση του Cu(II) σε σχέση με το πεπτίδιο αναφοράς Αβ5-9, με νικητή τελικά το H2N-Asn-His-Asp-Ser-Gly-amide.
Τα αποτελέσματα της εργασίας μας υποδεικνύουν πως υπάρχει η δυνατότητα περαιτέρω βελτιστοποίησης των παραγόντων που οδηγούν σε αυξημένη θερμοδυναμική σταθερότητα 3Ν συμπλόκων Cu(II) με πεπτίδια που φέρουν ελεύθερη Ν-τελική αμινομάδα και κατάλοιπο ιστιδίνης στη θέση 2. Οι παραπάνω μελέτες κρίνονται απαραίτητες ώστε τα εν λόγω σύμπλοκα να μπορούν να χρησιμοποιηθούν αποτελεσματικά σε βιολογικές-ιατρικές εφαρμογές.
In this MSc thesis, the interaction of Cu(II) ion with the peptides H2N-Lys-His-Asp-Ser-Gly-amide and H2N-Asn-His-Asp-Ser-Gly-amide was studied by means of potentiometric and spectroscopic techniques. Our main goal was the improvement of Cu(II) binding affinity of peptides containing a free N-amino group and a histidine residue at position 2 (i.e H2N-X-His-Y-Z-). In this respect, we chose to mutate the N-terminus amino acid of H2N-Arg-His-Asp-Ser-Gly-amide (Arg by Lys and Arg by Asn), a strong Cu(II) chelator [67], which was used as a reference. The latter, Aβ5-9 , is a model of the N-truncated Aβ5-42 species of the amyloid peptide (Aβ), which in turn, is known to be the main component of the amyloid plaques that form in the brain of patients suffering from Alzheimer's disease. The two peptides interacted efficiently with Cu(II) ions over the pH range 3-12, forming 1:1 Cu(II):peptide complexes. The metal coordination process was the expected one for peptides containing a N-terminus free amino group and a histidine residue in position 2 (i.e formation of 3N Cu(II) complexes, in which the coordination proposal involves the donors set (NH2, N-, Nim, X), where X=H2O or OH-). Both were also found to be more effective ligands for Cu(II) than the reference peptide Aβ5-9, with H2N-Asn-His-Asp-Ser-Gly-amide being the winner of this competition. The results of our work indicate that further optimization of the thermodynamic stability of 3N Cu(II) complexes with analogous peptides is possible. Strong Cu(II) chelators of this type can be used effectively in biological-medical applications.
In this MSc thesis, the interaction of Cu(II) ion with the peptides H2N-Lys-His-Asp-Ser-Gly-amide and H2N-Asn-His-Asp-Ser-Gly-amide was studied by means of potentiometric and spectroscopic techniques. Our main goal was the improvement of Cu(II) binding affinity of peptides containing a free N-amino group and a histidine residue at position 2 (i.e H2N-X-His-Y-Z-). In this respect, we chose to mutate the N-terminus amino acid of H2N-Arg-His-Asp-Ser-Gly-amide (Arg by Lys and Arg by Asn), a strong Cu(II) chelator [67], which was used as a reference. The latter, Aβ5-9 , is a model of the N-truncated Aβ5-42 species of the amyloid peptide (Aβ), which in turn, is known to be the main component of the amyloid plaques that form in the brain of patients suffering from Alzheimer's disease. The two peptides interacted efficiently with Cu(II) ions over the pH range 3-12, forming 1:1 Cu(II):peptide complexes. The metal coordination process was the expected one for peptides containing a N-terminus free amino group and a histidine residue in position 2 (i.e formation of 3N Cu(II) complexes, in which the coordination proposal involves the donors set (NH2, N-, Nim, X), where X=H2O or OH-). Both were also found to be more effective ligands for Cu(II) than the reference peptide Aβ5-9, with H2N-Asn-His-Asp-Ser-Gly-amide being the winner of this competition. The results of our work indicate that further optimization of the thermodynamic stability of 3N Cu(II) complexes with analogous peptides is possible. Strong Cu(II) chelators of this type can be used effectively in biological-medical applications.
Description
Keywords
3Ν συμπλόκα πεπτίδια, Πεπτίδια με ιστιδίνη, Θερμοδυναμικές παράμετροι, Βιολογικες - ιατρικές εφαρμογές, 3N peptide complexes, Histidin containing peptides, Thermodynamic parameters, Biological medical applications
Subject classification
Πεπτίδια
Citation
Link
Language
el
Publishing department/division
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Advisor name
Μαλανδρινός, Γεράσιμος
Examining committee
Μαλανδρινός, Γεράσιμος
Πλακατούρας, Ιωάννης
Γαρούφης, Αχιλλέας
Πλακατούρας, Ιωάννης
Γαρούφης, Αχιλλέας
General Description / Additional Comments
Institution and School/Department of submitter
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Table of contents
Sponsor
Bibliographic citation
Βιβλιογραφία: σ. 97-108
Name(s) of contributor(s)
Number of Pages
108 σ.
Course details
Endorsement
Review
Supplemented By
Referenced By
Creative Commons license
Except where otherwised noted, this item's license is described as Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States