Solution structure of an SRYD-containing sequence (250-257) of the fibronectin-like Leishmania gp63 protein by restrained molecular dynamics
Φόρτωση...
Ημερομηνία
Συγγραφείς
Orlewski, P.
Tsikaris, V.
Sakarellos-Daitsiotis, M.
Sakarellos, C.
Soteriadou, K. P.
Marraud, M.
Cung, M. T.
Τίτλος Εφημερίδας
Περιοδικό ISSN
Τίτλος τόμου
Εκδότης
Kluwer Academic Publishers
Περίληψη
Τύπος
Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο
Είδος περιοδικού
peer reviewed
Είδος εκπαιδευτικού υλικού
Όνομα συνεδρίου
Όνομα περιοδικού
Letters in Peptide Science
Όνομα βιβλίου
Σειρά βιβλίου
Έκδοση βιβλίου
Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος
Περιγραφή
The IASRYDQL synthetic octapeptide (250-257) of the Leishmania major surface glycoprotein gp63 efficiently inhibits parasite attachment to the macrophage receptors in in vitro experiments, and the SRYD-containing tetrapeptide mimics antigenically and functionally the RGDS sequence of fibronectin. The conformational properties of the octapeptide were investigated in dimethylsulfoxide (DMSO) with the combined use of NMR data (vicinal coupling constants, nuclear Overhauser effects (NOEs) and temperature coefficient values), molecular modeling by energy minimization and molecular dynamics. The structure is characterized by the high occurrence, exceeding 95%, of the Arg-Asp side-chain-side-chain ionic interaction, which plays a key role in the backbone folding through a distorted type-I beta-turn involving the Gln(256)-NH to Arg(253)-CO hydrogen bond.
Περιγραφή
Λέξεις-κλειδιά
leishmania gp63, 2d nmr, molecular dynamics, dmso solvent box, arginine ionic bridge, beta i-turn, dimethyl-sulfoxide, recognition site, cell-adhesion, rgd, peptides, grgdsp
Θεματική κατηγορία
Παραπομπή
Σύνδεσμος
<Go to ISI>://A1996WA48200007
http://www.springerlink.com/content/h5x231333042l588/fulltext.pdf
http://www.springerlink.com/content/h5x231333042l588/fulltext.pdf
Γλώσσα
en
Εκδίδον τμήμα/τομέας
Όνομα επιβλέποντος
Εξεταστική επιτροπή
Γενική Περιγραφή / Σχόλια
Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας