Υπολογιστική μελέτη των αλληλεπιδράσεων παραγώγων κινναμωμικού οξέος σε διαφόρους στόχους
Φόρτωση...
Ημερομηνία
Συγγραφείς
Ντάφλου, Αναστασία
Ntaflou, Anastasia
Τίτλος Εφημερίδας
Περιοδικό ISSN
Τίτλος τόμου
Εκδότης
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Περίληψη
Τύπος
Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο
Είδος περιοδικού
Είδος εκπαιδευτικού υλικού
Όνομα συνεδρίου
Όνομα περιοδικού
Όνομα βιβλίου
Σειρά βιβλίου
Έκδοση βιβλίου
Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος
μελέτη των φυσικοχημικών και τοξικολογικών τους ιδιοτήτων
study of their physicochemical and toxicological properties
study of their physicochemical and toxicological properties
Περιγραφή
Στα παράγωγα κινναμωμικού οξέος και τη χρήση τους στον σχεδιασμό νέων φαρμάκων, έχει
προσανατολιστείτα τελευταία χρόνια το ενδιαφέρον της επιστημονικής κοινότητας, εξαιτίας
της μεγάλης ποικιλίας των φαρμακολογικών δραστηριοτήτων και των πιθανών
θεραπευτικών εφαρμογών, που παρουσιάζουν. Η παρούσα μεταπτυχιακή εργασία,
παρουσιάζει αναλυτικά τη βιολογική δράση διαφόρων κινναμωμικών παραγώγων,
μελετώντας τη σχέση δομής-δραστικότητας και προσφέροντας, κατ΄ αυτόν τον τρόπο,
σημαντικές πληροφόρίες για τον ορθολογικό σχεδιασμό νέων ενώσεων με ενισχυμένη
αποτελεσματικότητα και μειωμένες παρενέργειες. Επίσης, εμβαθύνει στη σημασία του
υπολογιστικού σχεδιασμού των νέων υποψηφίων φαρμάκων, μέσω πειραμάτων μοριακής
πρόσδεσης (molecular docking). Τα πειράματα μοριακής πρόσδεσης πραγματοποιήθηκαν
μεταξύ 18 κινναμωμικών παραγώγων και 5 ενζύμων, με τη χρήση του λογισμικού Autodock
4. Μέσω του Autodock 4 εντοπίστηκαν οι ευνοϊκότερες διαμορφώσεις μορίου-στόχου και
υπολογίστηκαν οι τιμές της ενέργειας πρόσδεσης στις αντίστοιχες θέσεις. Στη συνέχεια, με
τη χρήση των λογισμικών SwissADME, pkCSM και ProTOX-II, εμβαθύναμε στην κατανόηση
και στην πρόβλεψη των φαρμακοκινητικών ιδιοτήτων (ADME: απορρόφηση, κατανομή,
μεταβολισμός και απέκκριση), καθώς και της τοξικότητας των υποψηφίων φαρμάκων.
Ακολούθησε επεξεργασία και σύγκριση των αποτελεσμάτων, με σκοπό την διεξαγωγή
συμπερασμάτων, τα οποία παρουσιάζονται αναλυτικά στο τέλος της εργασίας.
In recent years, there has been a growing interest in the derivatives of cinnamic acid and their potential application in drug design due to their diverse pharmacological activities. This master's thesis provides a detailed analysis of the biological actions of various cinnamic acid derivatives, investigating the structure-activity relationships to offer valuable insights for the rational design of novel compounds with enhanced efficacy and reduced side effects. The study further emphasizes the importance of computational design in drug discovery, specifically through molecular docking experiments using Autodock 4 software. Molecular docking experiments were conducted between 18 cinnamic acid derivatives and 5 enzymes, identifying favorable configurations of molecule-target interactions and calculating binding energy values at respective positions. Additionally, the research delves into the prediction of pharmacokinetic properties (ADME: absorption, distribution, metabolism, and excretion) and toxicity of the candidate drugs using SwissADME, pkCSM, and ProTOX-II softwares. The results were processed and compared to draw conclusions, providing a comprehensive understanding of the potential pharmacological properties and toxicological aspects of the studied compounds. The results were processed and compared, in order to draw conclusions, which are presented in detail at the end of the paper.
In recent years, there has been a growing interest in the derivatives of cinnamic acid and their potential application in drug design due to their diverse pharmacological activities. This master's thesis provides a detailed analysis of the biological actions of various cinnamic acid derivatives, investigating the structure-activity relationships to offer valuable insights for the rational design of novel compounds with enhanced efficacy and reduced side effects. The study further emphasizes the importance of computational design in drug discovery, specifically through molecular docking experiments using Autodock 4 software. Molecular docking experiments were conducted between 18 cinnamic acid derivatives and 5 enzymes, identifying favorable configurations of molecule-target interactions and calculating binding energy values at respective positions. Additionally, the research delves into the prediction of pharmacokinetic properties (ADME: absorption, distribution, metabolism, and excretion) and toxicity of the candidate drugs using SwissADME, pkCSM, and ProTOX-II softwares. The results were processed and compared to draw conclusions, providing a comprehensive understanding of the potential pharmacological properties and toxicological aspects of the studied compounds. The results were processed and compared, in order to draw conclusions, which are presented in detail at the end of the paper.
Περιγραφή
Λέξεις-κλειδιά
Παράγωγα κινναμωμικού οξέος, Βιολογική δράση, Υποψήφια φάρμακα, Υπολογιστικός σχεδιασμός φαρμάκων, Μοριακή μοντελοποίηση, Αλληλεπιδράσεις μορίου στόχου, Μοριακή πρόσδεση, Ενέργεια πρόσδεσης, Φαρμακοκινητικές ιδιότητες, Τοξικότητα, Cinnamic acid derivatives, Biological activity, Candidate drugs, Computational drug design, Molecular modeling, Ligand-target interactions, Molecular docking, Binding energy, Pharmacokinetic properties, Toxicity, Autodock 4, SwissADME, pkCSM, ProTOX-II
Θεματική κατηγορία
Χημεία, Chemistry
Παραπομπή
Σύνδεσμος
Γλώσσα
el
Εκδίδον τμήμα/τομέας
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Όνομα επιβλέποντος
Μαυρομούστακος, Θωμάς
Εξεταστική επιτροπή
Μαυρομούστακος, Θωμάς
Κουρκουμέλης, Νικόλας
Χατζηκακού, Σωτήριος
Κουρκουμέλης, Νικόλας
Χατζηκακού, Σωτήριος
Γενική Περιγραφή / Σχόλια
Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών
Πίνακας περιεχομένων
Χορηγός
Βιβλιογραφική αναφορά
Ονόματα συντελεστών
Αριθμός σελίδων
95
Λεπτομέρειες μαθήματος
item.page.endorsement
item.page.review
item.page.supplemented
item.page.referenced
Άδεια Creative Commons
Άδεια χρήσης της εγγραφής: Attribution 3.0 United States