Τεχνικές Μηχανικής Μάθησης για τη διανυσματική αναπαράσταση Γράφων Βιολογικών Δεδομένων

dc.contributor.authorΚαραδήμας, Οδυσσέαςel
dc.contributor.authorKaradimas, Odysseasen
dc.date.accessioned2024-10-11T09:53:53Z
dc.date.available2024-10-11T09:53:53Z
dc.identifier.urihttps://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/38446
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.26268/heal.uoi.18151
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/*
dc.subjectΒιολογικά δεδομέναel
dc.subjectΔιανυσματοποίησηel
dc.subjectΠρωτεϊνικές αλληλεπιδράσειςel
dc.subjectΓράφοιel
dc.subjectΜηχανική μάθησηel
dc.subjectΒιοπληροφορικήel
dc.subjectBiological dataen
dc.subjectVectorization
dc.subjectProtein interactions
dc.subjectGraphs
dc.subjectMachine learning
dc.subjectBioinformatics
dc.titleΤεχνικές Μηχανικής Μάθησης για τη διανυσματική αναπαράσταση Γράφων Βιολογικών Δεδομένωνel
dc.titleMachine Learning Techniques for vectorized representation of Biological Data Graphsen
dc.typemasterThesisen
heal.abstractΟ αυξανόμενος όγκος βιολογικών δεδομένων που παράγονται από πειράματα παρουσιάζει σημαντικές προκλήσεις για την ανάλυση και την ερμηνεία, ενώ συχνά αφήνει ανεξερεύνητες πολύτιμες γνώσεις λόγω υπολογιστικών περιορισμών. Η αναπαράσταση μεγάλων βιολογικών συνόλων δεδομένων σε διανυσματική μορφή αποτελεί μια κρίσιμη προσέγγιση για την αντιμετώπιση αυτών των προκλήσεων, προσφέροντας ένα κλιμακούμενο και αποτελεσματικό μέσο για την επεξεργασία και την ανάλυση πολύπλοκων δεδομένων. Η παρούσα διατριβή επικεντρώνεται στην αναπαράσταση δεδομένων πρωτεϊνικής αλληλεπίδρασης (Protein – Protein Interactions, PPI), τα οποία δομούνται σε μορφή γράφου, γεγονός που δημιουργεί σημαντικές δυσκολίες για τις καθιερωμένες μεθοδολογίες ανάλυσης της θεωρίας γράφων, όταν εφαρμόζονται σε σύνολα δεδομένων μεγάλης κλίμακας. Η έρευνα αυτή αναδεικνύει τη σημασία της διανυσματικής αναπαράστασης στην υπέρβαση αυτών των περιορισμών, παρέχοντας μια νέα προσέγγιση που αξιοποιεί προηγμένες τεχνικές μείωσης των διαστάσεων για την οπτικοποίηση δεδομένων υψηλής διάστασης σε διαχειρίσιμες μορφές. Με τη μετατροπή των δεδομένων PPI σε διανυσματική μορφή, επιτρέπουμε την αποτελεσματικότερη ομαδοποίηση και τον εντοπισμό λειτουργικών σχέσεων μεταξύ πρωτεϊνών, διευκολύνοντας την ανακάλυψη κρυμμένων μοτίβων και γνώσεων. Η εργασία αυτή αποτελεί σημαντική πρόοδο στον τομέα της βιοπληροφορικής, προσφέροντας ισχυρά εργαλεία για την ανάλυση πολύπλοκων βιολογικών συστημάτων και ανοίγοντας το δρόμο για μελλοντικές έρευνες και ανακαλύψεις.el
heal.abstractThe increasing volume of biological data generated from experiments presents significant challenges for analysis and interpretation, often leaving valuable insights undiscovered due to computational limitations. Representing large biological datasets in vector form is a crucial approach to address these challenges, offering a scalable and efficient means to process and analyze complex data. This thesis focuses on the representation of ProteinProtein Interaction (PPI) data, traditionally structured in graph format, which poses significant difficulties for traditional graph theory approaches, when applied to large-scale datasets. Our research highlights the importance of vector representation in overcoming these limitations, providing a novel approach that leverages advanced dimensionality reduction techniques to visualize high-dimensional data in manageable forms. By converting PPI data into vector form, we enable more effective clustering and identification of functional relationships between proteins, facilitating the discovery of hidden patterns and insights. This work represents a significant advancement in the field of bioinformatics, offering powerful tools for the analysis of complex biological systems and paving the way for future research and breakthroughs.en
heal.academicPublisherΠανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών. Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιώνel
heal.academicPublisherΤμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιώνel
heal.academicPublisherIDuoiel
heal.accessfreeel
heal.advisorNameΚαρβέλης, Πέτροςel
heal.committeeMemberNameΣτύλιος, Χρυσόστομοςel
heal.committeeMemberNameΣκορίλας, Ανδρέαςel
heal.dateAvailable2024-10-11T09:54:53Z
heal.fullTextAvailabilitytrue
heal.languageelel
heal.numberOfPages118el
heal.publicationDate2024-10-04
heal.recordProviderΠανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιώνel
heal.recordProviderΤμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιώνel
heal.typemasterThesisel
heal.type.elΜεταπτυχιακή εργασίαel
heal.type.enMaster thesisen

Αρχεία

Πρωτότυπος φάκελος/πακέτο

Προβολή: 1 - 1 of 1
Φόρτωση...
Μικρογραφία εικόνας
Ονομα:
Μ.Ε. Καραδήμας Οδυσσέας (2024).pdf
Μέγεθος:
6.37 MB
Μορφότυπο:
Adobe Portable Document Format
Περιγραφή:

Φάκελος/Πακέτο αδειών

Προβολή: 1 - 1 of 1
Φόρτωση...
Μικρογραφία εικόνας
Ονομα:
license.txt
Μέγεθος:
3.22 KB
Μορφότυπο:
Item-specific license agreed upon to submission
Περιγραφή: