Non-replication and inconsistency in the genome-wide association setting
Φόρτωση...
Ημερομηνία
Συγγραφείς
Ioannidis, J. P.
Τίτλος Εφημερίδας
Περιοδικό ISSN
Τίτλος τόμου
Εκδότης
Περίληψη
Τύπος
Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο
Είδος περιοδικού
peer-reviewed
Είδος εκπαιδευτικού υλικού
Όνομα συνεδρίου
Όνομα περιοδικού
Hum Hered
Όνομα βιβλίου
Σειρά βιβλίου
Έκδοση βιβλίου
Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος
Περιγραφή
Non-replication and inconsistency had been common features in the search for common variants of candidate genes affecting the risk of complex diseases. They may continue to require attention in the current era, when massive hypothesis-free testing of genetic variants is feasible. An empirical evaluation of the early experience with genome-wide association (GWA) studies suggests several examples where proposed associations have failed to be replicated by subsequent investigations. Non-replication and inconsistency is defined here in the framework of cumulative meta-analysis. Ideally, associations exist, GWA finds them, and subsequent investigations should replicate them. However, a number of other possibilities need to be considered. No common genetic variants may associate with the phenotype of interest and GWA may find nothing; or associations may exist, but GWA may miss them. Associations that do not exist may be falsely selected by the GWA and subsequent studies may appropriately refute them or falsely replicate them. Finally, GWA may find true associations that are nevertheless falsely non-replicated in the subsequent studies; or associations may be genuinely inconsistent across study populations. A list of options is presented for consideration in each of these scenarios.
Περιγραφή
Λέξεις-κλειδιά
*Genetic Predisposition to Disease, Genome, Human/*genetics, Humans, Meta-Analysis as Topic, Phenotype, *Polymorphism, Genetic
Θεματική κατηγορία
Παραπομπή
Σύνδεσμος
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17551261
http://content.karger.com/ProdukteDB/produkte.asp?Aktion=ShowPDF&ArtikelNr=000103512&Ausgabe=233256&ProduktNr=224250&filename=000103512.pdf
http://content.karger.com/ProdukteDB/produkte.asp?Aktion=ShowPDF&ArtikelNr=000103512&Ausgabe=233256&ProduktNr=224250&filename=000103512.pdf
Γλώσσα
en
Εκδίδον τμήμα/τομέας
Όνομα επιβλέποντος
Εξεταστική επιτροπή
Γενική Περιγραφή / Σχόλια
Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής