Enhancement of Multichannel Chromosome Classification Using a Region-Based Classifier and Vector Median Filtering

Φόρτωση...
Μικρογραφία εικόνας

Ημερομηνία

Συγγραφείς

Karvelis, P. S.
Fotiadis, D. I.
Tsalikakis, D. G.
Georgiou, I. A.

Τίτλος Εφημερίδας

Περιοδικό ISSN

Τίτλος τόμου

Εκδότης

Περίληψη

Τύπος

Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο

Είδος περιοδικού

peer reviewed

Είδος εκπαιδευτικού υλικού

Όνομα συνεδρίου

Όνομα περιοδικού

Ieee Transactions on Information Technology in Biomedicine

Όνομα βιβλίου

Σειρά βιβλίου

Έκδοση βιβλίου

Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος

Περιγραφή

Multichannel chromosome image acquisition is used for cancer diagnosis and research on genetic disorders. This type of imaging, apart from aiding the cytogeneticist in several ways, facilitates the visual detection of chromosome abnormalities. However, chromosome misclassification errors result from different factors, such as uneven hybridization, spectral overlap among fluors, and biochemical noise. In this paper, we enhance the chromosome classification accuracy by making use of a region Bayes classifier that increases the classification accuracy when compared to the already developed pixel-by-pixel classifier and by incorporating the vector median filtering approach for filtering of the image. The method is evaluated using a publicly available database that contains 183 six-channel chromosome sets of images. The overall improvement on the chromosome classification accuracy is 9.99%, compared to the pixel-by-pixel classifier without filtering. This improvement in the chromosome classification accuracy would allow subtle deoxyribonucleic acid abnormalities to be identified easily. The efficiency of the method might further improve by using features extracted from each region and a more sophisticated classifier.

Περιγραφή

Λέξεις-κλειδιά

bayes rule, chromosome, vector median filter (vmf), watershed transform (wt), in-situ hybridization, color images, directional filters, m-fish, identification, segmentation, localization, algorithm, noise

Θεματική κατηγορία

Παραπομπή

Σύνδεσμος

<Go to ISI>://000267835800019

Γλώσσα

en

Εκδίδον τμήμα/τομέας

Όνομα επιβλέποντος

Εξεταστική επιτροπή

Γενική Περιγραφή / Σχόλια

Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος

Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Μηχανικών Επιστήμης Υλικών

Πίνακας περιεχομένων

Χορηγός

Βιβλιογραφική αναφορά

Ονόματα συντελεστών

Αριθμός σελίδων

Λεπτομέρειες μαθήματος

item.page.endorsement

item.page.review

item.page.supplemented

item.page.referenced