HEGESMA: genome search meta-analysis and heterogeneity testing
Φόρτωση...
Ημερομηνία
Συγγραφείς
Zintzaras, E.
Ioannidis, J. P.
Τίτλος Εφημερίδας
Περιοδικό ISSN
Τίτλος τόμου
Εκδότης
Περίληψη
Τύπος
Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο
Είδος περιοδικού
peer-reviewed
Είδος εκπαιδευτικού υλικού
Όνομα συνεδρίου
Όνομα περιοδικού
Bioinformatics
Όνομα βιβλίου
Σειρά βιβλίου
Έκδοση βιβλίου
Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος
Περιγραφή
SUMMARY: Heterogeneity and genome search meta-analysis (HEGESMA) is a comprehensive software for performing genome scan meta-analysis, a quantitative method to identify genetic regions (bins) with consistently increased linkage score across multiple genome scans, and for testing the heterogeneity of the results of each bin across scans. The program provides as an output the average of ranks and three heterogeneity statistics, as well as corresponding significance levels. Statistical inferences are based on Monte Carlo permutation tests. The program allows both unweighted and weighted analysis, with the weights for each study as specified by the user. Furthermore, the program performs heterogeneity analyses restricted to the bins with similar average ranks. AVAILABILITY: http://biomath.med.uth.gr.
Περιγραφή
Λέξεις-κλειδιά
Chromosome Mapping, Computational Biology/*instrumentation/*methods, *Genetic Linkage, Genetic Markers, *Genetic Predisposition to Disease, Genome, *Genome, Human, Genotype, Humans, Linkage Disequilibrium, Lod Score, Meta-Analysis as Topic, Monte Carlo Method, Pedigree, Software
Θεματική κατηγορία
Παραπομπή
Σύνδεσμος
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15955784
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/21/18/3672.full.pdf
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/21/18/3672.full.pdf
Γλώσσα
en
Εκδίδον τμήμα/τομέας
Όνομα επιβλέποντος
Εξεταστική επιτροπή
Γενική Περιγραφή / Σχόλια
Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος
Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής