Μοριακή ταυτοποίηση και φυλογενετική ανάλυση απομονωθέντος παρασίτου Dirofilaria repens

Απλή σελίδα τεκμηρίου
dc.contributor.authorΠέρτσαλης, Αθανάσιοςel
dc.date.accessioned2019-03-20T07:33:53Z
dc.date.available2019-03-20T07:33:53Z
dc.identifier.urihttps://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/29325
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.26268/heal.uoi.3072
dc.rightsDefault License
dc.subjectΦυλογενετική ανάλυσηel
dc.subjectΦυλογενετικά δέντραel
dc.subjectΠαράσιτοel
dc.subjectΒιοπληροφορικήel
dc.subjectΜοριακή ταυτοποίησηel
dc.subjectMEGA-Xen
dc.subjectNCBIen
dc.subject12S rRNAen
dc.subject18S rRNAen
dc.subjectCOIen
dc.subjectDirofilaria repensen
dc.subjectParasiteen
dc.subjectBioinformaticsen
dc.subjectPhylogenetic analysisen
dc.subjectPhylogenetic treesen
dc.subjectMolecular identificationen
dc.titleΜοριακή ταυτοποίηση και φυλογενετική ανάλυση απομονωθέντος παρασίτου Dirofilaria repensel
dc.titleMolecular identification and phylogenetic analysis of isolated parasite of the species Dirofilaria repensen
heal.abstractΗ φυλογενετική, υποκλάδος της επιστήμης της εξελικτικής βιολογίας, με τη βοήθεια της βιοπληροφορικής, αποτελεί το πλέον αξιόπιστο μέσο για την μοριακή ταυτοποίηση των παρασίτων που προκαλούν νόσο στον άνθρωπο. Στην παρούσα μελέτη έγινε μία προσπάθεια εισαγωγής στον τομέα της φυλογενετικής ανάλυσης, μέσω συνολικής περιγραφής των πιο χαρακτηριστικών μεθοδολογιών και προβλημάτων της. Συγκεκριμένα επιχειρήθηκε να περιγραφούν τα διάφορα τμήματα κατασκευής ενός φυλογενετικού δέντρου και να ταυτοποιηθεί μοριακά ένας έλμινθας, ο οποίος είχε αφαιρεθεί χειρουργικά από ανθρώπινο οφθαλμό, μέσω σύγκρισης των 12S rRNA (MK192091), 18S rRNA (MK192092, MK192093) και COI (MK210632) αλληλουχιών του με αντίστοιχες αλληλουχίες άλλων οργανισμών, στην ανάλογη βάση δεδομένων του NCBI, με χρήση του πακέτου λογισμικού MEGA-X. Οι αλληλουχίες 12S και 18S rRNA του υπό μελέτη έλμινθα παρουσίασαν συντελεστή ομοιότητας 100% και η COI 99% με αντίστοιχες αλληλουχίες ελμίνθων του είδους Dirofilaria repens με προέλευση από την Ιταλία (KX265072, AB973229 και AB973225 αντίστοιχα), γεγονός που οδήγησε και στην τελική ταυτοποίησή του ως Dirofilaria repens.el
heal.abstractPhylogenetics, which is a subfield of evolutionary biology, in combination with bioinformatics is currently considered to be the most reliable tool for accurate molecular identification of parasites causing human or animal diseases. An extensive synopsis of the most typical methodologies and problems encountered is presented, together with a phylogenetic tree building process description. Additionally, the molecular identification of a nematode helminth surgically removed from a human eye and microscopically being identified as Dirofilaria spp. was performed. The molecular identification was based on the comparison of the 12S rRNA (MK192091), 18S rRNA (MK192092, MK192093) and COI (MK210632) sequences of this helminth with the respective sequences of other organisms using the MEGA-X software package and the proper database provided by NCBI. The 12S rRNA and 18S rRNA parasite of interest sequences proved to be identical (100% similarity), while its COI sequence was 99% similar to Dirofilaria repens sequences from Italy (KX265072, AB973229 and AB973225 respectively). These findings resulted to its identification as nematode of the species Dirofilaria repens.en
heal.academicPublisherΠανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικήςel
heal.academicPublisherIDuoi
heal.accessfree
heal.advisorNameΜποζίδης, Πέτροςel
heal.bibliographicCitationΒιβλιογραφία: σ. 70-77el
heal.classificationΒιοπληροφορικήel
heal.committeeMemberNameΜποζίδης, Πέτροςel
heal.committeeMemberNameΠαπαδοπούλου, Χρυσάνθηel
heal.committeeMemberNameΣακκάς, Ηρακλήςel
heal.dateAvailable2019-03-20T07:34:53Z
heal.fullTextAvailabilitytrue
heal.languageel
heal.numberOfPages77 σ.
heal.publicationDate2019
heal.recordProviderΠανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικήςel
heal.typemasterThesis
heal.type.elΜεταπτυχιακή εργασίαel
heal.type.enMaster thesisen

Αρχεία

Πρωτότυπος φάκελος/πακέτο

Προβολή: 1 - 1 of 1
Μικρογραφία εικόνας
Ονομα:
Μ.Ε. ΠΕΡΤΣΑΛΗΣ ΑΘΑΝΑΣΙΟΣ 2019.pdf
Μέγεθος:
1.63 MB
Μορφότυπο:
Adobe Portable Document Format
Περιγραφή:
Κατεβάστε

Φάκελος/Πακέτο αδειών

Προβολή: 1 - 1 of 1
Μικρογραφία εικόνας
Ονομα:
license.txt
Μέγεθος:
1.71 KB
Μορφότυπο:
Item-specific license agreed upon to submission
Περιγραφή:
Κατεβάστε

Συλλογές

Διατριβές Μεταπτυχιακής Έρευνας (Masters) - ΙΑΤ