Initiation of transcription at the human terminal deoxynucleotidyl transferase gene promoter: a novel role for the TATA binding protein

Φόρτωση...
Μικρογραφία εικόνας

Ημερομηνία

Συγγραφείς

Sorscher, D. H.
Yang, B.
Bhaumik, D.
Trangas, T.
Philips, A. V.
Chancellor, K. E.
Coleman, M. S.

Τίτλος Εφημερίδας

Περιοδικό ISSN

Τίτλος τόμου

Εκδότης

Περίληψη

Τύπος

Είδος δημοσίευσης σε συνέδριο

Είδος περιοδικού

peer reviewed

Είδος εκπαιδευτικού υλικού

Όνομα συνεδρίου

Όνομα περιοδικού

Biochemistry

Όνομα βιβλίου

Σειρά βιβλίου

Έκδοση βιβλίου

Συμπληρωματικός/δευτερεύων τίτλος

Περιγραφή

Control of initiation of transcription of the human terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) gene was investigated by using an in vitro transcription assay. The precise contribution of discrete basal promoter elements to transcription initiation was determined by testing deletion and substitution mutations. The primary element, contained within the region spanning -34 to -14 bp relative to the transcription start site, accounted for 80% of basal promoter activity. TdT promoter activity required the sequence ACCCT at -24 to -20 bp since a dramatic decrease in transcription initiation was observed after mutation of this sequence, whereas mutation of the adjacent sequence from -32 to -25 bp did not alter promoter activity. The secondary element contained sequences surrounding the transcription start site and had 20% of promoter activity. Deletion of both elements completely abolished transcription initiation. Initiator characteristics of the secondary element were revealed by using the in vitro assay: promoter sequences at the transcription start site were sufficient to direct accurate initiation at a single site. Mutation of the sequence GGGTG spanning the transcription start site resulted in loss of transcription initiation. Both the primary and secondary elements were nonhomologous to corresponding regions from the mouse TdT gene promoter. While the human basal promoter functioned in the absence of TATA consensus sequences or GC-rich SP1 binding sites, it was dependent on active TFIID. In contrast to other TATA-less promoters, purified TATA binding protein substituted for the TFIID complex and restored promoter activity to TFIID-inactivated nuclear extracts.

Περιγραφή

Λέξεις-κλειδιά

Base Sequence, Cell Line, DNA Nucleotidylexotransferase/*genetics, DNA Primers, DNA-Binding Proteins/*metabolism, HeLa Cells, Humans, Molecular Sequence Data, Mutagenesis, Mutation, *Promoter Regions, Genetic, Sequence Deletion, *TATA Box, TATA-Box Bind

Θεματική κατηγορία

Παραπομπή

Σύνδεσμος

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8086419

Γλώσσα

en

Εκδίδον τμήμα/τομέας

Όνομα επιβλέποντος

Εξεταστική επιτροπή

Γενική Περιγραφή / Σχόλια

Ίδρυμα και Σχολή/Τμήμα του υποβάλλοντος

Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών και Τεχνολογιών. Τμήμα Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών

Πίνακας περιεχομένων

Χορηγός

Βιβλιογραφική αναφορά

Ονόματα συντελεστών

Αριθμός σελίδων

Λεπτομέρειες μαθήματος

item.page.endorsement

item.page.review

item.page.supplemented

item.page.referenced